在厌氧条件下，聚磷菌将胞内储藏的聚磷分解，产生磷酸盐进入液体中（吸磷），同时产生的能量可供聚磷菌的生理活动之需，用于主动吸收外界环境中的碳源并将它们以聚羟基烷酸盐的形式储存。