采用DNA芯片进行基因表达差异分析的研究时，可以直接将提纯的mRNA分子用于与DNA芯片的杂交，注意保证避免RNA酶对样品的降解即可。

进行DNA芯片检测时，首先要将mRNA分子反转录成为cDNA分子，其一可以防止样品降解损失，其二，在此过程中，cDNA上需要进行标记，以便后续进行对比分析表达差异的基因。