中国科协名誉主席是在1986年6月中国科协三届一次全国委员会会议上决定设立的荣誉称号。
名誉主席授予德高望重、年事已高、曾担任过中国科协主席或副主席并对科协事业作出贡献的着名科学家和专家。名誉主席参加中国科协的重要会议和活动，可受主席委托代表中国科协参加重要的国内或国际活动。
第三届全国委员会第一次会议推举周培源、严济慈、茅以升为名誉主席。第四届全国委员会第一次会议推举钱学森、钱三强为名誉主席。
第五届全国委员会第一次会议授予朱光亚、卢嘉锡、吴阶平为名誉主席。